Образовательная программа магистратуры на факультете фундаментальной физико-химической инженерии реализуется в соответствии с требованиями самостоятельно устанавливаемого Московским государственным университетом имени М.В.Ломоносова образовательного стандарта высшего образования по направлению подготовки «Прикладные математика и физика».
В аспирантуру могут поступать выпускники магистратуры или специалитета. Основным содержанием является научно-исследовательская работа под руководством научного руководителя.
Студенты факультета проживают в общежитии "Дом аспиранта и стажёра" на пересечении Большой Черёмушкинской улицы и улицы Шверника. В него входят два 16-этажных корпуса, соединённых между собой переходом.
